Fue creado en abril de 1991 por el Ministro de Educación Mariano Baptista Gumucio y la entonces Directora de la Casa de la Cultura Cecilia kenning y fue reabierto al público en 1997, con la finalidad de promocionar la amplia colección del arte contemporáneo cruceño, como su nombre lo indica.

El museo presenta exposiciones permanentes y temporales de arte moderno de artistas nacionales y extranjeros, tanto en pinturas como en esculturas.  También se realizan exposiciones de la Historia del Arte Cruceño del siglo XX y de la época colonial. Este espacio cultural contiene seis salas de exposiciones, una sala de conferencias, una para la realización de talleres de arte, cursos de cerámico y otra sala de venta de obras de artistas plásticos.

Se ha dispuesto espacios para apoyar con sus instalaciones como sede informativa del Festival Internacional de Música Renacentista y Barroca Americana «Misiones de Chiquitos» y del Festival Internacional de Teatro «Santa Cruz de la Sierra» organizado por APAC (Asociación Pro Arte y Cultura).